Paket: cd-hit (4.8.1-3)

Länkar för cd-hit

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet cd-hit:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Tim Booth (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [weizhongli-lab.org]

Liknande paket:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Andra paket besläktade med cd-hit

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [ej amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, i386, mipsel]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta cd-hit

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	510,1 kbyte	1.411,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	493,7 kbyte	1.309,0 kbyte	[filförteckning]
armel	492,1 kbyte	1.319,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	487,5 kbyte	1.111,0 kbyte	[filförteckning]
i386	510,9 kbyte	1.477,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	510,7 kbyte	1.588,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	511,1 kbyte	1.541,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	508,6 kbyte	1.813,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	496,5 kbyte	1.429,0 kbyte	[filförteckning]