Paket: abyss (2.2.5+dfsg-1)

Länkar för abyss

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet abyss:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Märken: Field: Biologi, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Andra paket besläktade med abyss

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: bsdextrautils

extra utilities from 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC stödbibliotek
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

SQLite 3 shared library
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: make

utility for directing compilation
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries
dep: openmpi-common

high performance message passing library -- common files
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Hämta abyss

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.939,3 kbyte	9.045,0 kbyte	[filförteckning]