Paket: megadepth (1.2.0-4)

Länkar för megadepth

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet megadepth:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Andra paket besläktade med megadepth

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)

C library for handling bigWig files
dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC stödbibliotek
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU standardbibliotek v3 för C++

sug: r-bioc-megadepth

BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Hämta megadepth

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
ppc64el	81,5 kbyte	338,0 kbyte	[filförteckning]