Balík: velvet (1.2.10+dfsg1-9)

Odkazy pre velvet

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík velvet:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analyzovanie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom velvet

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2) [nie armel, armhf]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armel, armhf]

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Stiahnuť velvet

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	662.2 kB	1,276.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	642.6 kB	1,399.0 kB	[zoznam súborov]
armel	659.7 kB	1,364.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	643.7 kB	1,052.0 kB	[zoznam súborov]
i386	688.9 kB	1,466.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	658.0 kB	1,511.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	669.4 kB	1,590.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	700.9 kB	1,332.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	662.4 kB	1,337.0 kB	[zoznam súborov]