Balík: murasaki-mpi (1.68.6-13 a iné)

Odkazy pre murasaki-mpi

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík murasaki:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobné balíky:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki-mpi

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

knižnica Boost.Iostreams
dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

podporná knižnica GCC
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Stiahnuť murasaki-mpi

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64el	1.68.6-13+b4	719.3 kB	6,503.0 kB	[zoznam súborov]