Balík: biobambam2 (2.0.185+ds-2)

Odkazy pre biobambam2

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík biobambam2:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [gitlab.com]

Podobné balíky:

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Ostatné balíky súvisiace s balíkom biobambam2

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 7)

podporná knižnica GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

collection of data structures and algorithms for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť biobambam2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
i386	9,933.6 kB	71,707.0 kB	[zoznam súborov]