[ bookworm ] [ trixie ] [ sid ]

Zdrojový balík: snpeff (5.1+d+dfsg-3)

Odkazy pre snpeff

Zdroje Debian:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [pcingola.github.io]

Nasledovné binárne balíky sú zostavované z tohto zdrojového balíka:

libsnpeff-java: genetic variant annotation and effect prediction toolbox - lib
libsnpeff-java-doc: Documentation for Snp Effect
snpeff: genetic variant annotation and effect prediction toolbox - tool

Ostatné balíky súvisiace s balíkom snpeff

build-depends

build-depends-indep

adep: debhelper-compat (= 13)

Balík nie je dostupný
adep: javahelper

Helper scripts for packaging Java programs
adep: default-jdk

Standard Java or Java compatible Development Kit
adep: default-jdk-doc

Standard Java or Java compatible Development Kit (documentation)
adep: maven-debian-helper

Helper tools for building Debian packages with Maven
adep: libmaven-assembly-plugin-java

Maven Assembly Plugin
adep: libtrove3-java

high performance collections for java
adep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
adep: libbiojava6-java

Java API to biological data and applications (version 6)
adep: junit5

JUnit regression test framework for Java
adep: libcommons-codec-java

kodéry a dekodéry kodekov ako base64 a šestnástková sústava
adep: libcommons-io-java

bežné triedy týkajúce sa V/V
adep: libcommons-cli-java

knižnica na spracovanie argumentov a volieb príkazového riadka
adep: libcommons-math3-java

odľahčené matematické a štatistické komponenty pre jazyk Java
adep: libfreemarker-java

template engine written in Java
adep: libjaxb-api-java

Java Architecture for XML Binding API
adep: libmaven-javadoc-plugin-java

Maven Javadoc Plugin
adep: libbiojava6-java-doc

[Biology] Documentation for BioJava 6
adep: libtrove3-java-doc

high performance collections for java
adep: libcharts4j-java

free, lightweight charts and graphs Java API
adep: libapfloat-java

high performance arbitrary precision arithmetic library for Java
adep: libdistlib-java

Java library of statistical distribution functions

Download snpeff

Súbor	Veľkosť (v kB)	kontrolný súčet MD5
snpeff_5.1+d+dfsg-3.dsc	2.5 kB	a223df2b7a1103cc2f0a9ec9baf49ee2
snpeff_5.1+d+dfsg.orig.tar.xz	131,587.5 kB	2124876a86ba3d0af6b26bf6faaf26fa
snpeff_5.1+d+dfsg-3.debian.tar.xz	13.9 kB	78da84bbf07cf75de09203f390622619

Úložisko zdrojových balíkov Debianu (VCS: Git): https://salsa.debian.org/med-team/snpeff.git
Úložisko zdrojových balíkov Debianu (možno prezerať): https://salsa.debian.org/med-team/snpeff