Balík: r-bioc-tfbstools (1.40.0+dfsg-1 a iné)

Odkazy pre r-bioc-tfbstools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík r-bioc-tfbstools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bioconductor.org]

Podobné balíky:

GNU R Transcription Factor Binding Site (TFBS) Analysis

TFBSTools is a package for the analysis and manipulation of transcription factor binding sites. It includes matrices conversion between Position Frequency Matirx (PFM), Position Weight Matirx (PWM) and Information Content Matrix (ICM). It can also scan putative TFBS from sequence/alignment, query JASPAR database and provides a wrapper of de novo motif discovery software.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-tfbstools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: r-api-3.5 [sh4, sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-4.0 [nie sh4, sparc64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-bioc-3.18 [nie sh4, sparc64, x32]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sh4, sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sh4, sparc64]

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biobase (>= 2.28)

base functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.14.0)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.2.21)

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.36.4)

GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.36.3)

BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
dep: r-bioc-cner (>= 1.4.0)

CNE Detection and Visualization
dep: r-bioc-dirichletmultinomial (>= 1.10.0)

Dirichlet-Multinomial Mixture Model Machine Learning for Microbiome Data
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.6.1)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.20.6)

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
dep: r-bioc-iranges (>= 2.2.7)

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.28.10)

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-seqlogo (>= 1.34.0)

GNU R sequence logos for DNA sequence alignments
dep: r-bioc-xvector (>= 0.8.0)

BioConductor representation and manpulation of external sequences
dep: r-cran-catools (>= 1.17.1)

GNU R package providing various utility functions
dep: r-cran-dbi (>= 0.6)

balík GNU R poskytujúci všeobecné databázové rozhranie
dep: r-cran-gtools (>= 3.5.0)

balík GNU R s programovacími nástrojmi pre R, ktoré napísali Greg Warnes et al
dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

Database Interface R driver for SQLite
dep: r-cran-tfmpvalue (>= 0.0.5)

GNU R P-Value Computation for Position Weight Matrices
dep: r-cran-xml (>= 3.98-1.3)

GNU R package for XML parsing and generation

sug: r-bioc-biocstyle (>= 1.7.7) [nie sh4, sparc64]

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-cran-knitr (>= 1.11)

balík GNU R na dynamickú tvorbu zostáv pomocou Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown [nie sh4, sparc64]

convert R markdown documents into a variety of formats
sug: r-cran-testthat

GNU R testsuite

Stiahnuť r-bioc-tfbstools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.40.0+dfsg-1	979.2 kB	1,892.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.40.0+dfsg-1	980.0 kB	1,841.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.40.0+dfsg-1	979.9 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.40.0+dfsg-1	979.8 kB	1,836.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.40.0+dfsg-1	980.6 kB	1,841.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.40.0+dfsg-1	980.0 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.40.0+dfsg-1	980.2 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.40.0+dfsg-1	980.6 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.40.0+dfsg-1+b1	979.9 kB	1,838.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.40.0+dfsg-1	980.5 kB	1,841.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.20.0+dfsg-1	874.6 kB	1,736.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.20.0+dfsg-1	874.2 kB	1,737.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.36.0+dfsg-2	987.8 kB	1,852.0 kB	[zoznam súborov]