všetky možnosti
experimental  ]
[ Zdroj: libssw  ]

Balík: libssw1 (1.2.5-1 a iné)

Odkazy pre libssw1

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík libssw:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libssw1

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť libssw1

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
alpha (neoficiálny port) 1.2.5-1 24.3 kB85.0 kB [zoznam súborov]
amd64 1.2.5-1 20.9 kB56.0 kB [zoznam súborov]
arm64 1.2.5-1 19.4 kB84.0 kB [zoznam súborov]
armel 1.2.5-1 20.2 kB56.0 kB [zoznam súborov]
armhf 1.2.5-1 20.7 kB52.0 kB [zoznam súborov]
i386 1.2.5-1 25.2 kB80.0 kB [zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port) 1.2.5-1 28.7 kB89.0 kB [zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port) 1.2.5-1 23.1 kB68.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 1.2.5-1 24.5 kB86.0 kB [zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port) 1.2.5-1 25.4 kB84.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 1.2.5-1 19.7 kB84.0 kB [zoznam súborov]
riscv64 1.2.5-1+b1 25.4 kB57.0 kB [zoznam súborov]
s390x 1.2.5-1 24.7 kB68.0 kB [zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port) 1.2.5-1 26.9 kB84.0 kB [zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port) 1.2.5-1 23.0 kB1,046.0 kB [zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port) 1.2.5-1 20.8 kB56.0 kB [zoznam súborov]