Balík: sepp (4.3.10+dfsg-5)

Odkazy pre sepp

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík sepp:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

phylogeny with ensembles of Hidden Markov Models

The tools SEPP and TIPP implementing these methods use ensembles of Hidden Markov Models (HMMs) in different ways, each focusing on a different problem.

SEPP stands for "SATe-enabled Phylogenetic Placement", and addresses the problem of phylogenetic placement of short reads into reference alignments and trees.

TIPP stands for "Taxonomic Identification and Phylogenetic Profiling", and addresses the problem of taxonomic identification and abundance profiling of metagenomic data.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sepp

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
dep: libcommons-beanutils-java

Apache Commons BeanUtils - Utility for manipulating Java beans
dep: libcommons-collections3-java

Apache Commons Collections - rozšírené API Collections pre Javu
dep: libcommons-lang-java

Commons Lang - rozšírenie balíka java.lang
dep: libcommons-logging-java

rozhranie spoločné pre niekoľko API na zaznamenávanie udalostí
dep: libgoogle-gson-java

konvertuje objekty jazyka Java do ich reprezentácie v JSON
dep: libjenkins-json-java

Library for transforming Java objects between XML and JSON
dep: libjson-java

library for transforming Java objects and XML to JSON and back again
dep: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
dep: pplacer

phylogenetic placement and downstream analysis
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-dendropy

DendroPy Phylogenetic Computing Library (Python 3)

Stiahnuť sepp

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	179.6 kB	551.0 kB	[zoznam súborov]