Balík: samtools (1.11-1)

Odkazy pre samtools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík samtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.htslib.org]

Podobné balíky:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Klient, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Sada nástrojov používateľského rozhrania: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtrovanie, Works with: Biologické sekvencie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom samtools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libhts3 (>= 1.11)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

zdieľané knižnice na obsluhu terminálu
dep: libtinfo6 (>= 6)

zdieľaná nízkoúrovňová knižnica terminfo na obsluhu terminálu
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Stiahnuť samtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
ppc64el	559.1 kB	1,669.0 kB	[zoznam súborov]