Balík: miniasm (0.3+dfsg-2)

Odkazy pre miniasm

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík miniasm:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Značky: Biológia: Nucleic Acids, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Výpočet, use::comparing, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom miniasm

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Stiahnuť miniasm

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	29.6 kB	70.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	27.8 kB	66.0 kB	[zoznam súborov]
armel	28.3 kB	66.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	26.8 kB	54.0 kB	[zoznam súborov]
i386	31.9 kB	74.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	30.4 kB	78.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	30.0 kB	77.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	32.6 kB	83.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	28.5 kB	74.0 kB	[zoznam súborov]