[ Zdroj: python-pauvre ]
Balík: python3-pauvre (0.2.2-2)
Odkazy pre python3-pauvre
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík python-pauvre:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Andreas Tille (Stránka QA)
- Étienne Mollier (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
QC and genome browser plotting Oxford Nanopore and PacBio long reads
Pauvre is a plotting package designed for nanopore and PacBio long reads.
This package currently hosts four scripts for plotting and/or printing stats.
pauvre marginplot Takes a fastq file as input and outputs a marginal histogram with a heatmap. pauvre stats Takes a fastq file as input and prints out a table of stats, including how many basepairs/reads there are for a length/mean quality cutoff. This is also automagically called when using pauvre marginplot pauvre redwood Method of representing circular genomes. A redwood plot contains long reads as "rings" on the inside, a gene annotation "cambrium/phloem", and a RNAseq "bark". The input is .bam files for the long reads and RNAseq data, and a .gff file for the annotation. pauvre synteny Makes a synteny plot of circular genomes. Finds the most parsimonius rotation to display the synteny of all the input genomes with the fewest crossings-over. Input is one .gff file per circular genome and one directory of gene alignments.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pauvre
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-matplotlib
- systém v Pythone na vykresľovanie v štýle podobnom Matlabu - Python 3
-
- dep: python3-numpy
- schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3
-
- dep: python3-pandas
- údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“
-
- dep: python3-scipy
- vedecké nástroje pre Python 3
-
- dep: python3-sklearn
- Python modules for machine learning and data mining - Python 3
-
- dep: python3-tk
- Tkinter - písanie aplikácií Tk v jazyku Python 3.x
Stiahnuť python3-pauvre
Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|
all | 50.0 kB | 279.0 kB | [zoznam súborov] |