Balík: bedtools (2.30.0+dfsg-1)

Odkazy pre bedtools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík bedtools:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Konverzia dát, use::filtering, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bedtools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbz2-1.0

kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

komprimačná knižnica formátu XZ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť bedtools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	647.5 kB	2,060.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	565.4 kB	1,864.0 kB	[zoznam súborov]
armel	535.4 kB	1,759.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	559.3 kB	1,275.0 kB	[zoznam súborov]
i386	708.4 kB	2,275.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	585.1 kB	2,591.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	603.6 kB	2,459.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	663.0 kB	2,520.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	567.1 kB	2,100.0 kB	[zoznam súborov]