Balík: canu (2.0+dfsg-1)

Odkazy pre canu

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík canu:

Správca:

Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)

Externé zdroje:

Domovská stránka [canu.readthedocs.org]

Podobné balíky:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Ostatné balíky súvisiace s balíkom canu

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: gnuplot

program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

modul na zistenie informácií o mieste na disku
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

podporná knižnica GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: mhap (>= 2.1.3)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus

Balík nie je dostupný

Stiahnuť canu

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armhf	1,101.1 kB	6,673.0 kB	[zoznam súborov]