Balík: concavity (0.1+dfsg.1-5)

Odkazy pre concavity

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík concavity:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [compbio.cs.princeton.edu]

Podobné balíky:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Ostatné balíky súvisiace s balíkom concavity

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

štandardná knižnica C++ GNU v3

sug: conservation-code

protein sequence conservation scoring tool
sug: pymol

systém na vykresľovanie molekúl

Stiahnuť concavity

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
armel	224.9 kB	933.0 kB	[zoznam súborov]