Balík: libbio-samtools-perl (1.43-3 a iné)

Odkazy pre libbio-samtools-perl

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík libbio-samtools-perl:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [metacpan.org]

Podobné balíky:

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Značky: Software Development: Perl Development, Knižnice, Implementované v: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Vývojová knižnica, Shared Library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libbio-samtools-perl

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbio-perl-perl

BioPerl - základné moduly jazyka Perl
dep: libc6 (>= 2.15)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: perl (>= 5.32.0-4)

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: perlapi-5.32.0

virtuálny balík poskytovaný balíkom perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

enh: gbrowse

GMOD Generic Genome Browser
enh: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Stiahnuť libbio-samtools-perl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1.43-3+b1	194.0 kB	625.0 kB	[zoznam súborov]