[ Zdroj: pairtools ]
Balík: python3-pairtools (1.0.2-2 a iné)
Odkazy pre python3-pairtools
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík pairtools:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:
- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pairtools
|
|
|
|
-
- dep: cython3
- rozšírenia v jazyku C pre Python 3
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-bioframe
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- wrapper optparse na tvorbu mocných nástrojov príkazového riadka - Python 3.x
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)
- schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3
-
- dep: python3-numpy-abi9
- virtuálny balík poskytovaný balíkom python3-numpy
-
- dep: python3-pandas
- údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“
-
- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-scipy
- vedecké nástroje pre Python 3
-
- dep: python3-yaml
- spracovanie a tvorbu YAML v jazyku Python 3
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
Stiahnuť python3-pairtools
Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1.0.2-2+b1 | 161.5 kB | 685.0 kB | [zoznam súborov] |
arm64 | 1.0.2-2+b1 | 147.9 kB | 702.0 kB | [zoznam súborov] |
armel | 1.0.2-2+b1 | 144.8 kB | 622.0 kB | [zoznam súborov] |
armhf | 1.0.2-2+b1 | 144.9 kB | 554.0 kB | [zoznam súborov] |
i386 | 1.0.2-2+b1 | 160.8 kB | 674.0 kB | [zoznam súborov] |
mips64el | 1.0.2-2+b1 | 146.4 kB | 776.0 kB | [zoznam súborov] |
mipsel | 1.0.2-2+b1 | 144.8 kB | 702.0 kB | [zoznam súborov] |
ppc64el | 1.0.2-2+b1 | 158.4 kB | 766.0 kB | [zoznam súborov] |