Пакет: bwa (0.7.18-1)

Ссылки для bwa

Ресурсы Debian:

Исходный код bwa:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [bio-bwa.sourceforge.net]

Подобные пакеты:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Теги: Биология: Протеины, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Пользовательский интерфейс: Командная строка, interface::text-mode, role::program, Цель: Анализ, Сравнение

Другие пакеты, относящиеся к bwa

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf]

библиотека сжатия

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

rec: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка bwa

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	206,9 Кб	459,0 Кб	[список файлов]
arm64	193,6 Кб	447,0 Кб	[список файлов]
armel	194,1 Кб	438,0 Кб	[список файлов]
armhf	193,3 Кб	326,0 Кб	[список файлов]
i386	231,1 Кб	522,0 Кб	[список файлов]
mips64el	204,7 Кб	526,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	230,2 Кб	575,0 Кб	[список файлов]
riscv64	214,6 Кб	375,0 Кб	[список файлов]
s390x	222,8 Кб	511,0 Кб	[список файлов]