[ Источник: ngmlr ]
Пакет: ngmlr (0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2 и другие)
Ссылки для ngmlr
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код ngmlr:
- [ngmlr_0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2.dsc]
- [ngmlr_0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg.orig.tar.gz]
- [ngmlr_0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads
Ngmlr is a long-read mapper designed to sensitively align PacBilo or Oxford Nanopore to (large) reference genomes. It was designed to quickly and correctly align the reads, including those spanning (complex) structural variations. Ngmlr uses an SV aware k-mer search to find approximate mapping locations for a read and then a banded Smith- Waterman alignment algorithm to compute the final alignment. Ngmlr uses a convex gap cost model that penalizes gap extensions for longer gaps less than for shorter ones to compute precise alignments.
Другие пакеты, относящиеся к ngmlr
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libssw0 (>= 1.1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
Загрузка ngmlr
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1 | 673,7 Кб | 1 157,0 Кб | [список файлов] |