Пакет: abyss (2.3.9-1)

Ссылки для abyss

Ресурсы Debian:

Исходный код abyss:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к abyss

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: bsdextrautils

дополнительные инструменты из 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.38)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не ppc64el, riscv64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

динамически подключаемая библиотека SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 14)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: make

утилита управления компиляцией
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries
dep: openmpi-common

high performance message passing library -- common files
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

Загрузка abyss

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	3 242,0 Кб	10 011,0 Кб	[список файлов]
arm64	2 993,3 Кб	10 611,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3 105,1 Кб	12 554,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3 156,3 Кб	12 403,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3 182,1 Кб	8 235,0 Кб	[список файлов]