Пакет исходного кода: spades (3.13.0+dfsg2-2)
Ссылки для spades
Ресурсы Debian:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
Из этого пакета исходного кода собираются следующие двоичные пакеты:
- spades
- genome assembler for single-cell and isolates data sets
Другие пакеты, относящиеся к spades
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- вспомогательные программы для debian/rules
-
- adep:
dh-python
- вспомогательные инструменты для создания Debian-пакетов для библиотек и приложений на Python
-
- adep:
cmake
- cross-platform, open-source make system
-
- adep:
python-all-dev
- package depending on all supported Python2 development packages
-
- adep:
zlib1g-dev
- библиотека сжатия (файлы для разработчиков)
-
- adep:
libbz2-dev
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (версия для разработки)
-
- adep:
libboost-dev
- Boost C++ Libraries development files (default version)
-
- adep:
libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
-
- adep:
libbamtools-dev
- C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- adep:
libhat-trie-dev
- Development headers and static libraries for HAT-trie library
также виртуальный пакет, предоставляемый
libhat-trie-dev
-
- adep:
libhts-dev
- development files for the HTSlib
-
- adep:
libnlopt-dev
- nonlinear optimization library -- development package
-
- adep:
libnlopt-cxx-dev
- nonlinear optimization library -- development package for C++
-
- adep:
libssw-dev
- Development headers and static libraries for libssw
также виртуальный пакет, предоставляемый
libssw-dev
-
- adep:
python-yaml
- YAML parser and emitter for Python
-
- adep:
python-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
-
- adep:
asciidoctor
(>= 1.5.3)
- перевод из формата AsciiDoc в HTML для Ruby
-
- adep:
bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
-
- adep:
libbwa-dev
- Burrows-Wheeler Aligner source files
-
- adep:
lynx
- класcический веб-браузер для текстового режима
