Пакет: vt (0.57721+ds-3 и другие)

Ссылки для vt

Ресурсы Debian:

Исходный код vt:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [genome.sph.umich.edu]

Подобные пакеты:

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Другие пакеты, относящиеся к vt

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0 [sparc64]

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

удобная библиотека для передачи данных клиента по URL (GnuTLS)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

библиотека для работы с архивами в формате XZ
dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

новая библиотека поддержки регулярных выражений Perl — 8-битный вариант
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

инструментарий Secure Sockets Layer — разделяемые библиотеки
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

library implementing support vector machines
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

GNU R standalone mathematics library
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

библиотека сжатия

Загрузка vt

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b1	694,3 Кб	3 221,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 Кб	2 902,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.57721+ds-3+b1	667,7 Кб	2 578,0 Кб	[список файлов]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 Кб	2 361,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657,9 Кб	1 661,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b2	695,5 Кб	2 646,0 Кб	[список файлов]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 Кб	3 065,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b1	906,8 Кб	5 619,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b2	735,5 Кб	2 777,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 Кб	3 505,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b1	702,2 Кб	3 218,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 Кб	3 090,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 Кб	2 342,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 Кб	2 834,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b2	931,7 Кб	2 642,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b2	597,0 Кб	3 097,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.57721+ds-3+b1	822,2 Кб	2 813,0 Кб	[список файлов]