Пакет: samblaster (0.1.26-4 и другие)

Ссылки для samblaster

Ресурсы Debian:

Исходный код samblaster:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

marks duplicates, extracts discordant/split reads

Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.

samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.

Другие пакеты, относящиеся к samblaster

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.8) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка samblaster

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.1.26-4	24,8 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.1.26-4	24,3 Кб	62,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.1.26-4	23,1 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
armel	0.1.26-4	22,8 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.1.26-4	22,8 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.1.26-4	25,2 Кб	62,0 Кб	[список файлов]
i386	0.1.26-4	25,1 Кб	61,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.1.26-4	29,6 Кб	93,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.1.26-4	24,3 Кб	61,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.1.26-4	25,9 Кб	89,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.1.26-4	25,7 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.1.26-4	26,5 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.1.26-4+b1	24,2 Кб	55,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.1.26-4	22,6 Кб	57,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.1.26-4	26,9 Кб	85,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.1.26-4	23,2 Кб	1 047,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.1.26-4	24,3 Кб	57,0 Кб	[список файлов]