все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: maqview  ]

Пакет: maqview (0.2.5-11 и другие)

Ссылки для maqview

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код maqview:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

graphical read alignment viewer for short gene sequences

Maqview is graphical read alignment viewer. It is specifically designed for the Maq alignment file and allows you to see the mismatches, base qualities and mapping qualities. Maqview is nothing fancy as Consed or GAP, but just a simple viewer for you to see what happens in a particular region.

In comparison to tgap-maq, the text-based read alignment viewer written by James Bonfield, Maqview is faster and takes up much less memory and disk space in indexing. This is possibly because tgap aims to be a general-purpose viewer but Maqview fully makes use of the fact that a Maq alignment file has already been sorted. Maqview is also efficient in viewing and provides a command-line tool to quickly retrieve any region in an Maq alignment file.

Другие пакеты, относящиеся к maqview

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка maqview

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 0.2.5-11 126,6 Кб1 149,0 Кб [список файлов]
amd64 0.2.5-11 116,6 Кб889,0 Кб [список файлов]
arm64 0.2.5-11 110,0 Кб954,0 Кб [список файлов]
armel 0.2.5-11 99,4 Кб889,0 Кб [список файлов]
armhf 0.2.5-11 99,4 Кб825,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 0.2.5-11 113,9 Кб820,0 Кб [список файлов]
i386 0.2.5-11 125,2 Кб897,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 0.2.5-11 144,8 Кб1 389,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 0.2.5-11 102,9 Кб769,0 Кб [список файлов]
mips64el 0.2.5-11 118,0 Кб1 115,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 0.2.5-11 126,4 Кб1 147,0 Кб [список файлов]
ppc64el 0.2.5-11 125,1 Кб1 145,0 Кб [список файлов]
riscv64 0.2.5-11+b1 120,4 Кб794,0 Кб [список файлов]
s390x 0.2.5-11 109,9 Кб909,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 0.2.5-11 119,3 Кб889,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 0.2.5-11 100,1 Кб4 419,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 0.2.5-11 116,0 Кб833,0 Кб [список файлов]