Пакет: belvu (4.44.1+dfsg-7.1 и другие)

Ссылки для belvu

Ресурсы Debian:

Исходный код seqtools:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.sanger.ac.uk]

Подобные пакеты:

multiple sequence alignment viewer and phylogenetic tool

Belvu is a multiple sequence alignment viewer and phylogenetic tool with an extensive set of user-configurable modes to color residues.

 * View multiple sequence alignments.
 * Residues can be coloured by conservation, with user-configurable
   cutoffs and colours.
 * Residues can be coloured by residue type (user-configurable).
 * Colour schemes can be imported or exported.
 * Swissprot (or PIR) entries can be fetched by double clicking.
 * The position in the alignment can be easily tracked.
 * Manual deletion of rows and columns.
 * Automatic editing of rows and columns based on customisable criteria:
    - removal of all-gap columns;
    - removal of all gaps;
    - removal of redundant sequences;
    - removal of a column by a user-specified percentage of gaps;
    - filtering of sequences by percent identity;
    - removal of sequences by a user-specified percentage of gaps;
    - removal of partial sequences (those starting or ending with
      gaps); and
    - removal of columns by conservation (with user-specified
      upper/lower cutoffs).
 * The alignment can be saved in Stockholm, Selex, MSF or FASTA format.
 * Distance matrices between sequences can be generated using a variety
   of distance metrics.
 * Distance matrices can be imported or exported.
 * Phylogenetic trees can be constructed based on various distance-based
   tree reconstruction algorithms.
 * Trees can be saved in New Hampshire format.
 * Belvu can perform bootstrap phylogenetic reconstruction.

Теги: Инструментарий интерфейса: GTK

Другие пакеты, относящиеся к belvu

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

инструментарий специальных возможностей ATK
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

библиотека для двухмерной векторной графики Cairo
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [не alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)
dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

общая библиотека настроек шрифтов (динамическая версия)
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

движок отрисовки шрифтов FreeType 2 (динамически загружаемые библиотеки)
dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

библиотека GDK Pixbuf
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.22.0)

библиотека С-функций
dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0) [alpha, sparc64]

GTK graphical user interface library - old version
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.12.0) [не alpha, sparc64]

GTK graphical user interface library - old version
dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

вычисление позиций символов OpenType (библиотека)
dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5) [sparc64]

library for reading and writing JSON for C++
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка belvu

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 028,7 Кб	1 277,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 030,2 Кб	1 231,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 019,6 Кб	1 275,0 Кб	[список файлов]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 013,9 Кб	1 190,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 014,1 Кб	1 138,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 026,4 Кб	1 221,0 Кб	[список файлов]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 038,7 Кб	1 262,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 051,1 Кб	1 457,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 028,3 Кб	1 241,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 032,6 Кб	1 360,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 037,5 Кб	1 338,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 037,4 Кб	1 339,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 027,4 Кб	1 191,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 025,0 Кб	1 247,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 042,5 Кб	1 274,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 014,9 Кб	1 990,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 029,8 Кб	1 213,0 Кб	[список файлов]