Пакет: autodock (4.2.6-9 и другие)

Ссылки для autodock

Ресурсы Debian:

Исходный код autodocksuite:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [autodock.scripps.edu]

Подобные пакеты:

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, works-with-format::TODO, Работает с: 3D-модель, Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к autodock

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29) [не alpha, ia64, riscv64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, sh4]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

sug: autogrid

pre-calculate binding of ligands to their receptor

Загрузка autodock

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.2.6-9	176,2 Кб	460,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.2.6-9	163,5 Кб	411,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.2.6-9	150,7 Кб	375,0 Кб	[список файлов]
armel	4.2.6-9	156,7 Кб	403,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.2.6-9	151,7 Кб	315,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	4.2.6-9	169,2 Кб	396,0 Кб	[список файлов]
i386	4.2.6-9	161,5 Кб	411,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	4.2.6-9	218,2 Кб	788,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.2.6-9	157,0 Кб	455,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.2.6-9	165,0 Кб	460,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	4.2.6-9	164,6 Кб	499,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.2.6-9	164,4 Кб	435,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.2.6-9+b1	169,2 Кб	373,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.2.6-9	149,3 Кб	395,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.2.6-9	197,2 Кб	388,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.2.6-9	162,7 Кб	470,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	4.2.6-9	163,3 Кб	399,0 Кб	[список файлов]