Пакет: freebayes (1.3.7-1~exp и другие)

Ссылки для freebayes

Ресурсы Debian:

Исходный код freebayes:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Другие пакеты, относящиеся к freebayes

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [не amd64]
dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [не amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]
dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

rec: parallel

параллельное выполнение команд

Загрузка freebayes

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1 453,0 Кб	4 027,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1 397,1 Кб	3 922,0 Кб	[список файлов]
armel	1.3.7-1~exp	1 378,4 Кб	3 821,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.3.7-1~exp	1 386,2 Кб	3 445,0 Кб	[список файлов]
i386	1.3.7-1~exp	1 502,3 Кб	4 185,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp+b1	1 573,9 Кб	5 599,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp+b1	1 404,1 Кб	3 930,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1 428,4 Кб	4 378,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp+b1	1 455,3 Кб	4 498,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1 473,5 Кб	4 307,0 Кб	[список файлов]
riscv64 (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp	1 435,6 Кб	3 701,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.3.7-1~exp	1 375,9 Кб	4 052,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp+b1	1 533,1 Кб	3 916,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.3.7-1~exp	1 357,1 Кб	4 639,0 Кб	[список файлов]