Пакет: khmer (2.1.2+dfsg-6)

Ссылки для khmer

Ресурсы Debian:

Исходный код khmer:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [khmer.readthedocs.org]

Подобные пакеты:

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Теги: Биология: Fasta/Pearson, Нуклеиновые кислоты, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c++, implemented-in::python, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, use::analysing, Цель: Сравнение, Фильтрация

Другие пакеты, относящиеся к khmer

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: cython3 (>= 0.26.1)

C-Extensions for Python 3
dep: khmer-common

common files for the khmer project tools
dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [arm64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [amd64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

dep: python3 (<< 3.8)

dep: python3 (>= 3.7~)
dep: python3-bz2file

Python3 library for reading and writing bzip2-compressed files
dep: python3-screed (>= 1.0)

short nucleotide read sequence utils in Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

библиотека сжатия

Загрузка khmer

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	6 488,5 Кб	29 563,0 Кб	[список файлов]
arm64	6 408,0 Кб	29 286,0 Кб	[список файлов]