Пакет: hinge (0.5.0-4)

Ссылки для hinge

Ресурсы Debian:

Исходный код hinge:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

long read genome assembler based on hinging

HINGE is a genome assembler that seeks to achieve optimal repeat resolution by distinguishing repeats that can be resolved given the data from those that cannot. This is accomplished by adding “hinges” to reads for constructing an overlap graph where only unresolvable repeats are merged. As a result, HINGE combines the error resilience of overlap-based assemblers with repeat-resolution capabilities of de Bruijn graph assemblers.

Другие пакеты, относящиеся к hinge

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: daligner

выравнивание длинных нуклеотидных последовательностей
dep: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
dep: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data
dep: libc6 (>= 2.27)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc1 (>= 1:4.5) [arm64]
dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: python

интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
dep: python-colormap

ease manipulation of matplotlib colormaps and color codecs (Python 2)
dep: python-configparser

backport of the enhanced config parser introduced in Python 3.2
dep: python-matplotlib

Python based plotting system in a style similar to Matlab
dep: python-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks
dep: python-numpy

быстрые методы работы с числовыми массивами – модуль для языка Python
dep: python-pbcore

Python 2 library for processing PacBio data files
dep: python-ujson

ultra fast JSON encoder and decoder for Python 2
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка hinge

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	421,7 Кб	2 790,0 Кб	[список файлов]
arm64	384,3 Кб	2 646,0 Кб	[список файлов]