[ Источник: cnvkit ]
Пакет: cnvkit (0.9.5-3)
Ссылки для cnvkit
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код cnvkit:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
- Steffen Moeller (Страница КК)
- Olivier Sallou (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [cnvkit.readthedocs.org]
Подобные пакеты:
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
A command-line toolkit and Python library for detecting copy number variants and alterations genome-wide from targeted DNA sequencing. It is designed for use with hybrid capture, including both whole-exome and custom target panels, and short-read sequencing platforms such as Illumina and Ion Torrent.
Другие пакеты, относящиеся к cnvkit
|
|
|
|
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 3)
-
- dep: python3-future
- Clean single-source support for Python 3 and 2 - Python 3.x
-
- dep: python3-matplotlib
- Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data - Python 3
-
- dep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-reportlab
- ReportLab library to create PDF documents using Python3
-
- dep: python3-scipy
- scientific tools for Python 3
-
- dep: r-bioc-dnacopy
- R package: DNA copy number data analysis
Загрузка cnvkit
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 22 378,8 Кб | 22 874,0 Кб | [список файлов] |