Пакет: python-biopython (1.73+dfsg-1)

Ссылки для python-biopython

Ресурсы Debian:

Исходный код python-biopython:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [biopython.org]

Подобные пакеты:

Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

This package is targeting Python version 2.

Теги: Разработка программного обеспечения: Разработка на Python, Библиотеки, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: Python, Роль: role::devel-lib, role::shared-lib

Другие пакеты, относящиеся к python-biopython

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: python

интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

быстрые методы работы с числовыми массивами – модуль для языка Python
dep: python-numpy-abi9

виртуальный пакет, предоставляемый python-numpy
dep: python-reportlab

библиотека ReportLab для создания PDF документов с помощью Python

rec: ncbi-blast+

поиск первичных биологических последовательностей
rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

Documentation for the Biopython library

sug: bwa [amd64]

Burrows-Wheeler Aligner
sug: clustalo

General purpose multiple sequence alignment program for proteins
sug: clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
sug: dialign

Segment-based multiple sequence alignment
sug: dssp

protein secondary structure assignment based on 3D structure
sug: emboss

European molecular biology open software suite
sug: fasttree

phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
sug: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
sug: muscle

Multiple alignment program of protein sequences
sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: phyml

Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
sug: prank

Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
sug: probcons

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
sug: python-matplotlib

Python based plotting system in a style similar to Matlab
sug: python-mysqldb

Python interface to MySQL
sug: python-pil

Python Imaging Library (Pillow fork)
sug: python-psycopg2

Python module for PostgreSQL
sug: python-rdflib (>= 4)

Python library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers
sug: python-renderpm

python low level render interface
sug: python-scipy

scientific tools for Python
sug: python-tk

Tkinter - Writing Tk applications with Python2
sug: raxml

синтез филогенетических деревьев по методу максимального правдоподобия
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
sug: t-coffee

Multiple Sequence Alignment
sug: w3-dtd-mathml

Mathematical Markup Language V2.0 DTD
sug: wise (>= 2.4.1-16)

comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

Загрузка python-biopython

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1 302,5 Кб	8 974,0 Кб	[список файлов]
arm64	1 291,9 Кб	8 907,0 Кб	[список файлов]
armhf	1 282,2 Кб	8 822,0 Кб	[список файлов]
i386	1 302,6 Кб	8 967,0 Кб	[список файлов]