Пакет: tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-8)

Ссылки для tree-ppuzzle

Ресурсы Debian:

Исходный код tree-puzzle:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.tree-puzzle.de]

Подобные пакеты:

Parallelized reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood

TREE-PUZZLE (the new name for PUZZLE) is an interactive console program that implements a fast tree search algorithm, quartet puzzling, that allows analysis of large data sets and automatically assigns estimations of support to each internal branch. TREE-PUZZLE also computes pairwise maximum likelihood distances as well as branch lengths for user specified trees. Branch lengths can also be calculated under the clock-assumption. In addition, TREE-PUZZLE offers a novel method, likelihood mapping, to investigate the support of a hypothesized internal branch without computing an overall tree and to visualize the phylogenetic content of a sequence alignment.

This is the parallelized version of tree-puzzle.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, use::comparing, Поддерживаемые форматы: Простой текст, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к tree-ppuzzle

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.0)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsprng2

SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

rec: tree-puzzle-doc

Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

sug: phylip

package of programs for inferring phylogenies
sug: treetool

Пакет недоступен

Загрузка tree-ppuzzle

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	183,0 Кб	436,0 Кб	[список файлов]
arm64	170,9 Кб	412,0 Кб	[список файлов]
armel	174,7 Кб	444,0 Кб	[список файлов]
armhf	166,0 Кб	328,0 Кб	[список файлов]
i386	195,2 Кб	532,0 Кб	[список файлов]
mips64el	182,8 Кб	515,0 Кб	[список файлов]
mipsel	182,7 Кб	495,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	192,8 Кб	557,0 Кб	[список файлов]
s390x	169,6 Кб	452,0 Кб	[список файлов]