Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-7)

Ссылки для velvet

Ресурсы Debian:

Исходный код velvet:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.ebi.ac.uk]

Подобные пакеты:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к velvet

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgomp1 (>= 4.9)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

библиотека сжатия

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Загрузка velvet

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	662,4 Кб	1 255,0 Кб	[список файлов]
arm64	643,7 Кб	1 214,0 Кб	[список файлов]
armel	659,4 Кб	1 344,0 Кб	[список файлов]
armhf	645,5 Кб	1 049,0 Кб	[список файлов]
i386	687,6 Кб	1 430,0 Кб	[список файлов]
mips64el	662,0 Кб	1 432,0 Кб	[список файлов]
mipsel	679,6 Кб	1 485,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	672,3 Кб	1 586,0 Кб	[список файлов]
s390x	648,1 Кб	1 302,0 Кб	[список файлов]