все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: repeatmasker-recon  ]

Пакет: repeatmasker-recon (1.08-6)

Ссылки для repeatmasker-recon

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код repeatmasker-recon:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

finds repeat families from biological sequences

The RECON package implements a de novo algorithm for the identification of repeat families from biological sequences.

The program implements an approach for the de novo identification and classification of repeat sequence families that is based on extensions to the usual approach of single linkage clustering of local pairwise alignments between genomic sequences. The extensions use multiple alignment information to define the boundaries of individual copies of the repeats and to distinguish homologous but distinct repeat element families. When tested on the human genome, this approach was able to properly identify and group known transposable elements. The program, should be useful for first-pass automatic classification of repeats in newly sequenced genomes.

Другие пакеты, относящиеся к repeatmasker-recon

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка repeatmasker-recon

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 83,1 Кб460,0 Кб [список файлов]
arm64 81,3 Кб452,0 Кб [список файлов]
armel 80,6 Кб447,0 Кб [список файлов]
armhf 78,0 Кб407,0 Кб [список файлов]
i386 85,3 Кб471,0 Кб [список файлов]
mips64el 84,4 Кб481,0 Кб [список файлов]
mipsel 84,4 Кб475,0 Кб [список файлов]
ppc64el 85,6 Кб656,0 Кб [список файлов]
s390x 81,3 Кб456,0 Кб [список файлов]