Пакет: mash (2.2.2+dfsg-2)

Ссылки для mash

Ресурсы Debian:

Исходный код mash:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [mash.readthedocs.io]

Подобные пакеты:

fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.

Другие пакеты, относящиеся к mash

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcapnp-0.7.0

Cap'n Proto C++ library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)

Portable MurmurHash Implementation
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка mash

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	149,5 Кб	443,0 Кб	[список файлов]
arm64	130,6 Кб	383,0 Кб	[список файлов]
mips64el	132,1 Кб	482,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	148,6 Кб	487,0 Кб	[список файлов]
s390x	129,0 Кб	431,0 Кб	[список файлов]