Пакет: macsyfinder (2.0~rc1-3 и другие)

Ссылки для macsyfinder

Ресурсы Debian:

Исходный код macsyfinder:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

detection of macromolecular systems in protein datasets

MacSyFinder is a program to model and detect macromolecular systems, genetic pathways... in protein datasets. In prokaryotes, these systems have often evolutionarily conserved properties: they are made of conserved components, and are encoded in compact loci (conserved genetic architecture). The user models these systems with MacSyFinder to reflect these conserved features, and to allow their efficient detection

This package presents the Open Source Java API to biological databases and a series of mostly sequence-based algorithms.

Другие пакеты, относящиеся к macsyfinder

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
dep: libjs-jquery

JavaScript library for dynamic web applications
dep: libjs-sphinxdoc (>= 2.4.3-5~)

JavaScript support for Sphinx documentation
dep: libjs-underscore

JavaScript's functional programming helper library
dep: ncbi-blast+

поиск первичных биологических последовательностей
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
dep: python3-colorlog

formatter to use with the logging module of Python 3
dep: python3-networkx

tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)
dep: python3-packaging

core utilities for python3 packages
dep: python3-yaml

YAML parser and emitter for Python3
dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 0.5.1+dfsg)

sphinx theme from readthedocs.org (common files)

Загрузка macsyfinder

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2.0~rc1-3+b1	11 320,2 Кб	33 920,0 Кб	[список файлов]
i386	2.0~rc1-3+b1	11 319,0 Кб	33 920,0 Кб	[список файлов]