Пакет: flexbar (1:3.5.0-3)

Ссылки для flexbar

Ресурсы Debian:

Исходный код flexbar:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

flexible barcode and adapter removal for sequencing platforms

Flexbar preprocesses high-throughput sequencing data efficiently. It demultiplexes barcoded runs and removes adapter sequences. Moreover, trimming and filtering features are provided. Flexbar increases mapping rates and improves genome and transcriptome assemblies. It supports next-generation sequencing data in fasta/q and csfasta/q format from Illumina, Roche 454, and the SOLiD platform.

Parameter names changed in Flexbar. Please review scripts. The recent months, default settings were optimised, several bugs were fixed and various improvements were made, e.g. revamped command-line interface, new trimming modes as well as lower time and memory requirements.

Другие пакеты, относящиеся к flexbar

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbz2-1.0

библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
dep: libc6 (>= 2.30)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 10.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libtbb2 (>= 2020.3)

parallelism library for C++ - runtime files
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка flexbar

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	285,4 Кб	1 025,0 Кб	[список файлов]