Пакет: biobambam2 (2.0.179+ds-1)

Ссылки для biobambam2

Ресурсы Debian:

Исходный код biobambam2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [gitlab.com]

Подобные пакеты:

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Другие пакеты, относящиеся к biobambam2

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.768+dfsg)

collection of data structures and algorithms for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 9)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

Загрузка biobambam2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	9 201,5 Кб	65 075,0 Кб	[список файлов]