все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: libtfbs-perl  ]

Пакет: libtfbs-perl (0.7.1+ds-2 и другие)

Ссылки для libtfbs-perl

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код libtfbs-perl:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

scanning DNA sequence with a position weight matrix

The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.

If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".

Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>

Теги: Разработка программного обеспечения: Разработка на Perl, Библиотеки, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Роль: Библиотека разработчика, Программа

Другие пакеты, относящиеся к libtfbs-perl

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка libtfbs-perl

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
s390x 0.7.1+ds-2+b2 226,3 Кб990,0 Кб [список файлов]