[ Источник: r-bioc-shortread ]
Пакет: r-bioc-shortread (1.56.1-1)
Ссылки для r-bioc-shortread
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код r-bioc-shortread:
- [r-bioc-shortread_1.56.1-1.dsc]
- [r-bioc-shortread_1.56.1.orig.tar.gz]
- [r-bioc-shortread_1.56.1-1.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [bioconductor.org]
Подобные пакеты:
GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.
Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-shortread
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: r-api-4.0
- виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16
- виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-rhtslib
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
-
- dep: r-cran-hwriter
- HTML Writer - Outputs R objects in HTML format
-
- dep: r-cran-lattice
- GNU R package for 'Trellis' graphics
-
- dep: r-cran-latticeextra
- GNU R package of additional graphical displays based on lattice
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-biomart
- GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
Загрузка r-bioc-shortread
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 5 042,4 Кб | 7 491,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 5 038,4 Кб | 7 541,0 Кб | [список файлов] |
| armel | 5 032,7 Кб | 7 479,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 5 034,4 Кб | 7 476,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 5 045,3 Кб | 7 506,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 5 033,1 Кб | 7 556,0 Кб | [список файлов] |
| mipsel | 5 033,1 Кб | 7 554,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 5 044,2 Кб | 7 605,0 Кб | [список файлов] |
| s390x | 5 038,8 Кб | 7 497,0 Кб | [список файлов] |