[ Источник: stacks ]
Пакет: stacks (2.62+dfsg-1)
Ссылки для stacks
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код stacks:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Tim Booth (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [creskolab.uoregon.edu]
Подобные пакеты:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Другие пакеты, относящиеся к stacks
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl-интерфейс к базам данных (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- библиотека сжатия
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
также виртуальный пакет, предоставляемый r-cran-littler
-
- rec: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
Загрузка stacks
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| arm64 | 955,8 Кб | 5 203,0 Кб | [список файлов] |