Pakiet: seqmagick (0.8.6-3)

Odnośniki dla seqmagick

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego seqmagick:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Inne pakiety związane z seqmagick

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-pygtrie

Python library implementing a trie data structure (Python 3)

Pobieranie seqmagick

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	39,1 KiB	214,0 KiB	[lista plików]