Pakiet: murasaki (1.68.6-14 i inne)

Odnośniki dla murasaki

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libc6 (>= 2.38)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 14)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.68.6-14+b1	629,6 KiB	4 400,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.6-14+b1	543,3 KiB	4 319,0 KiB	[lista plików]
armel	1.68.6-14	452,9 KiB	3 326,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.68.6-14	462,8 KiB	2 350,0 KiB	[lista plików]
i386	1.68.6-14	638,5 KiB	4 166,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.6-14+b1	596,1 KiB	5 866,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606,8 KiB	5 600,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.68.6-14+b1	584,6 KiB	3 203,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.6-14+b1	606,9 KiB	4 827,0 KiB	[lista plików]