[ Pakiet źródłowy: optimir ]
Pakiet: optimir (1.2-2)
Odnośniki dla optimir
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego optimir:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Integrating genetic variations in miRNA alignment
OptimiR is a miRSeq data alignment workflow. It integrates genetic information to assess the impact of variants on miRNA expression.
OptimiR: A bioinformatics pipeline designed to detect and quantify miRNAs, isomiRs and polymiRs from miRSeq data, & study the impact of genetic variations on polymiRs' expression.
Inne pakiety związane z optimir
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cutadapt
- Czyszczenie sekwencji biologicznych z odczytów sekwencjonowania o dużej przepustowości
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
-
- rec: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- rec: r-cran-gridextra
- GNU R package with extensions for the grid package
Pobieranie optimir
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| all | 1 002,4 KiB | 7 403,0 KiB | [lista plików] |