Pakiet: velvet (1.2.10+dfsg1-8 i inne)

Odnośniki dla velvet

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego velvet:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z velvet

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

sug: velvet-example

Example data for the Velvet sequence assembler

Pobieranie velvet

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	693,3 KiB	1 718,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.2.10+dfsg1-8	658,0 KiB	1 256,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.10+dfsg1-8	637,2 KiB	1 333,0 KiB	[lista plików]
armel	1.2.10+dfsg1-8	655,1 KiB	1 459,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.2.10+dfsg1-8	638,3 KiB	1 075,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	689,4 KiB	1 457,0 KiB	[lista plików]
i386	1.2.10+dfsg1-8	685,9 KiB	1 453,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	775,3 KiB	2 661,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	609,1 KiB	1 217,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.2.10+dfsg1-8	654,7 KiB	1 511,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	663,5 KiB	1 596,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.2.10+dfsg1-8	667,2 KiB	1 589,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.2.10+dfsg1-8+b1	699,0 KiB	1 343,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.2.10+dfsg1-8	642,5 KiB	1 301,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	662,9 KiB	1 457,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	662,0 KiB	4 671,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.2.10+dfsg1-8	657,6 KiB	1 245,0 KiB	[lista plików]