Pakiet: mummer (3.23+dfsg-8 i inne)

Odnośniki dla mummer

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego mummer:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [mummer.sourceforge.net]

Podobne pakiety:

Efficient sequence alignment of full genomes

MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::TODO, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z mummer

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: gawk

GNU awk, język wyszukiwania i obróbki wzorców tekstu
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 11) [nie riscv64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

Pobieranie mummer

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	654,6 KiB	3 963,0 KiB	[lista plików]
amd64	3.23+dfsg-8	646,2 KiB	3 307,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.23+dfsg-8	621,2 KiB	3 826,0 KiB	[lista plików]
armel	3.23+dfsg-8	616,5 KiB	3 745,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.23+dfsg-8	612,8 KiB	3 361,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	643,0 KiB	3 175,0 KiB	[lista plików]
i386	3.23+dfsg-8	653,4 KiB	3 297,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	702,7 KiB	4 138,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	633,3 KiB	3 193,0 KiB	[lista plików]
mips64el	3.23+dfsg-8	651,6 KiB	4 009,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	651,1 KiB	4 083,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.23+dfsg-8	655,8 KiB	4 019,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.23+dfsg-8+b1	648,4 KiB	3 067,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.23+dfsg-8	622,6 KiB	3 286,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	655,9 KiB	3 748,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	621,6 KiB	20 626,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	3.23+dfsg-8	643,1 KiB	3 173,0 KiB	[lista plików]