Pakiet: freebayes (1.3.7-1 i inne)

Odnośniki dla freebayes

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego freebayes:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Inne pakiety związane z freebayes

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nie amd64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [nie ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

Pobieranie freebayes

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.3.7-1	1 451,7 KiB	4 308,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.3.7-1	1 452,7 KiB	4 024,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.3.7-1	1 397,0 KiB	3 919,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.3.6-2+b1	1 561,5 KiB	5 564,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.3.6-2+b1	1 396,9 KiB	3 912,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.3.7-1	1 428,4 KiB	4 375,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.3.6-2+b1	1 458,5 KiB	4 480,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.3.7-1	1 473,4 KiB	4 304,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.3.7-1+b1	1 459,7 KiB	3 736,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.3.6-2+b1	1 531,0 KiB	3 898,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.3.6-2+b1	1 354,8 KiB	4 621,0 KiB	[lista plików]