Pakiet: q2-cutadapt (2024.5.0-1)

Odnośniki dla q2-cutadapt

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego q2-cutadapt:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [qiime2.org]

Podobne pakiety:

QIIME 2 plugin to work with adapters in sequence data

QIIME 2 is a powerful, extensible, and decentralized microbiome analysis package with a focus on data and analysis transparency. QIIME 2 enables researchers to start an analysis with raw DNA sequence data and finish with publication-quality figures and statistical results. Key features:

 * Integrated and automatic tracking of data provenance
 * Semantic type system
 * Plugin system for extending microbiome analysis functionality
 * Support for multiple types of user interfaces (e.g. API, command line,

graphical)

QIIME 2 is a complete redesign and rewrite of the QIIME 1 microbiome analysis pipeline. QIIME 2 will address many of the limitations of QIIME 1, while retaining the features that makes QIIME 1 a powerful and widely-used analysis pipeline.

QIIME 2 currently supports an initial end-to-end microbiome analysis pipeline. New functionality will regularly become available through QIIME 2 plugins. You can view a list of plugins that are currently available on the QIIME 2 plugin availability page. The future plugins page lists plugins that are being developed.

Inne pakiety związane z q2-cutadapt

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: cutadapt

Czyszczenie sekwencji biologicznych z odczytów sekwencjonowania o dużej przepustowości
dep: pigz

Parallel Implementation of GZip
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-numpy

Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)
dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data
dep: q2-types (>= 2024.5)

QIIME 2 plugin defining types for microbiome analysis
dep: qiime (>= 2024.5)

Quantitative Insights Into Microbial Ecology

Pobieranie q2-cutadapt

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 253,5 KiB	6 862,0 KiB	[lista plików]
arm64	2 253,5 KiB	6 862,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2 253,5 KiB	6 862,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2 253,5 KiB	6 862,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2 253,5 KiB	6 862,0 KiB	[lista plików]