wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

Pakiet: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-11 i inne)

Odnośniki dla libfastahack0

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego libfastahack:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Inne pakiety związane z libfastahack0

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie libfastahack0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 23,7 KiB82,0 KiB [lista plików]
amd64 1.0.0+dfsg-11+b1 26,9 KiB88,0 KiB [lista plików]
arm64 1.0.0+dfsg-11+b1 24,0 KiB88,0 KiB [lista plików]
armel 1.0.0+dfsg-11+b1 23,3 KiB70,0 KiB [lista plików]
armhf 1.0.0+dfsg-11+b1 23,5 KiB58,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 27,6 KiB78,0 KiB [lista plików]
i386 1.0.0+dfsg-11+b1 28,0 KiB82,0 KiB [lista plików]
ia64 (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 30,7 KiB117,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 25,1 KiB73,0 KiB [lista plików]
mips64el 1.0.0+dfsg-11+b1 24,7 KiB91,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 26,4 KiB145,0 KiB [lista plików]
ppc64el 1.0.0+dfsg-11+b1 27,0 KiB88,0 KiB [lista plików]
riscv64 1.0.0+dfsg-11+b1 24,8 KiB66,0 KiB [lista plików]
s390x 1.0.0+dfsg-11+b1 25,3 KiB78,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 27,9 KiB81,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 22,1 KiB1 051,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 1.0.0+dfsg-11 25,5 KiB69,0 KiB [lista plików]